Search :

Project Project Title : ความหลากหลายทางพันธุกรรมของ frankia ในประเทศไทย (Genetics diversity of Frankia in Thailand)     downloaded 46 times Researcher Name : หนึ่ง เตียอำรุง (Neung Teaumroong) Abstract : บทคัดย่อ จากการเก็บตัวอย่างดิน 2 ลักษณะ ได้แก่ แถบชายฝั่งทะเล และแผ่นดินใหญ่พบว่าจำนวนประชากรของ Frankia จากดินทรายแถบชายฝั่งทะเลมีจำนวนของ Frankia ที่สร้างปมให้กับสนทะเล และสนประดิพัทธ์ ได้มากกว่าจากดินในแผ่นดินใหญ่ โดยจำนวนปมที่พบเมื่อการทำการปลูกสนทั้งสองชนิด ในดินที่มีปริมาณเท่ากันจากบริเวณชายฝั่งทะเล มีจำนวนปมอยู่ในช่วง 7-370 ปม/ต้น ในขณะที่จากแผ่นดินใหญ่พบจำนวนปมอยู่ในช่วง 0-155 ปม/ต้น จากตัวอย่างที่สุ่มเก็บมาจากปมที่สร้างขึ้นในตัวอย่างดินชนิดต่าง ๆ จำนวน 315 ปม/ต้น สามารถนำมาแยกและเพาะเลี้ยงเป็นเชื้อบริสุทธิ์ได้เพียง 18 ไอโซเลท เมื่อนำมาทดสอบประสิทธิภาพการตรึงไนโตรเจนโดยวิธี ARA (Acetylene Reduction Assay) พบว่าให้ประสิทธิภาพอยู่ในช่วง 40-90 mol C2 H4/g-dw/h ในการทดลอง cross inoculation กับสนทั้งสองชนิดของเชื้อ Frankia ที่แยกได้พบว่าไม่มีนัยที่บอกถึง host specificity นั่นคือ Frankia ที่แยกได้จากสนทะเล สามารถสร้างปมได้ในสนประดิพัทธ์ โดยให้จำนวนปมไม่แตกต่างกัน และเช่นเดียวกันกับเมื่อนำ Frankia จากสนประดิพัทธ์ปลูกลงไปในสนทะเล จากผลการทดลองทาง DNA พบว่า Frankia ในดินประเทศไทยน่าจะมีความหลากหลายสูงมาก โดยดูจากจำนวนตัวอย่างที่สุ่มมา และสามารถเพิ่มจำนวนได้ 29 ตัวอย่าง ไม่มีตัวอย่างใดที่ให้แถบ DNA เป็นแบบเดียวกันเลย เมื่อทำการตรวจสอบจาก BOX-PCR เทคนิค และ Dendogram ที่ได้จากการทำ BOX-PCR นี้ไม่สามารถบอกถึงความสัมพันธ์ของ Frankia กับแหล่งอาศัยได้ จากนั้นทำการสุ่มตัวอย่าง Frankia มาอ่านลำดับเบสของยีนชุด 16S rRNA พบว่า Frankia ที่แยกได้แบ่งเป็น 2 กลุ่ม ซึ่ง Frankia บางสายพันธุ์มีความใกล้ชิดกับ Frankia ที่แยกได้จากพืช Alnus viridis มากกว่าบางสายพันธุ์ที่แยกได้จากสนทะเล (ที่รวบรวมไว้ใน Genbank) ในขณะที่ผลการวิเคราะห์ลำดับของ nif H gene พบว่า Frankia ที่แยกได้จากการทดลองครั้งนี้แยกได้ 2 กลุ่ม ซึ่งคล้ายกับ Phylogenetic tree ที่ได้จากลำดับเบสของ 16S rDNA กลุ่มที่แรกจะมีลำดับเบสของ nif H gene ใกล้เคียงกับ Frankia ใน Genbank (Frankia sp. Nodule FE37 : 0.36252) ในขณะที่อีกกลุ่มจะมีความคล้ายกับ Frankia สายพันธุ์อื่น ๆ ตัวอย่างที่ได้จากกลุ่มนี้ เช่น นครสวรรค์ ชุมพร ระยอง กระบี่ และประจวบคีรีขันธ์ จากผลการศึกษาครั้งนี้สิ่งที่แสดงให้เห็นชัดเจน คือ ดินในประเทศไทยมีความหลากหลายของ Frankia ที่สร้างปมและตรึงไนโตรเจนให้กับสนทะเล และสนประดิพัทธ์สูงมาก แสดงให้เห็นถึงศักยภาพที่จะนำมาใช้ประโยชน์ในทางการเกษตร และสร้างองค์ความรู้ของ Frankia ให้มากขึ้น Abstract In order to investigate the population of Frankia, the soil samples were collected from both main land and coast sites in Thailand. The population numbers of Frankia isolated from coast sites generally showed higher amount than that of mainland sites. The nodule numbers from both Casuriana equisetifolia and C. junghuniana when trapped in both soil types were also investigated. The amount of nodules formed in soil sample from coast sites was in the range between 7-370 nodules while from mainland sites was 0-155 nodules. The 315 nodules were obtained from various soil samples, only 18 isolated could be cultured. The nitrogenase activity (on the basis of Acetylene Reduction Assay : ARA) from these isolates was in the range between 40-90 mol C2 H4/g-dw/h. The cross inoculation between both Casuarianas was conducted. The results suggested that host specificity was no significantly be observed. In order to, investigate the biodiversity of Frankia on basis of DNA technique, BOX-PCR technique was used. The results demonstrated that among 29 nodule samples, their DNA fingerprints were different. When the dendogram was generated along with their DNA fingerprint, the relationship between Frankia strain and habitat was not found. When Frankia strains were analyzed on the basis of 16S rDNA, they could be divided into 2 main subgroups. Some strains showed more closely related to Alnus viridis Frankia than those of isolated from C. equisetifolia. On the other hand, when nifH regions were sequenced, it was also found 2 subgroups. The first subgroup was closely related to Frankia sp. Nodule FE37:0.36252 while the another subgroup showed similarity with other Frankia strains collected from Nakhonsawan, Chumporn, Rayong, Krabi ans Prajuabkirikhan provinces. From this study demonstrated the high diversity of Frankia as well as the potential to sue in agriculture practical. Publications : No  View Publications  Detail Award/Honor :  Name  Sponsor  Get Date

IRD SEARCH | IRD LOGIN